ชินสวมชุดโปรโตสูทได้รับบาดเจ็บสาหัสขณะช่วยชินจิโรจากการโจมตีของเบมูลาร์ ด้วยความสิ้นหวัง ชินจิโรกลับไปช่วยพ่อของเขา ชินจิโรถูกส่งไปปฏิบัติภารกิจเพื่อกำจัดมนุษย์ต่างดาวที่เป็นศัตรู แต่เป้าหมายกลับหลบหนีเข้าไปในเมือง ทำให้พลเรือนจำนวนนับไม่ถ้วนตกอยู่ในอันตราย ความไม่เต็มใจของชินจิโรที่จะประหารชีวิตเอเลี่ยนที่ฆ่ามนุษย์ต่างดาวสร้างความกังวลใจให้กับสายลับโมโรโบชิ ชินเล่าให้ลูกชายฟังถึงความหมายของการเป็นอุลตร้าแมน